基因编辑器蛋白 | Cas13/碱基编辑/先导编辑蛋白

Cas12j-8蛋白

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Cas12j-1蛋白

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Cas12j-3蛋白

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Cas12j-4蛋白

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Cas12j-5蛋白

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Cas12j-7蛋白

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Cas12j-9蛋白

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Cas12j-10蛋白

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Cas12j-SF05蛋白

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DpbCas12e蛋白

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Cas12l蛋白

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Cas12Pro蛋白

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GeCas12a2蛋白

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PE8a蛋白

PE8a（PE6a-D37）是一种基于Ec48逆转录酶（RT）的AI引导重设计引导编辑器（Prime Editor）。其RT结构域通过ProteinMPNN深度学习网络进行序列重设计，在保留PE6a催化活性的基础上，引入了30个氨基酸替换。该变体是目前PE8系列中编码序列最短的成员（5.6 kb），特别适用于对载体包装容量有严格限制的递送系统（如双AAV载体）。PE8a在纠正ClinVar数据库中数百种致病突变时表现出平均2.1倍的编辑效率提升，同时在mRNA-LNP递送后其细胞内蛋白表达水平较PE6a提升1.2倍，是兼具紧凑尺寸与高效编辑能力的理想选择。

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PE8c蛋白

PE8c（PE6c-D8）是一种基于Tf1逆转录酶（RT）的AI引导重设计引导编辑器（Prime Editor）。其RT结构域通过ProteinMPNN进行深度序列重设计，在保留PE6c高催化活性的基础上，引入了117个氨基酸替换，全局序列差异达23%。重设计显著提升了该蛋白的折叠稳定性与热稳定性（熔解温度Tm较PE6c提升8°C），mRNA-LNP递送后的细胞内蛋白水平提升2.3倍。PE8c在多种递送模式下表现突出：在ClinVar 700种致病突变筛选中平均编辑效率提升1.4倍；在小鼠肝脏PCSK9位点实现14%体内编辑效率（较PE6c提升1.4倍）；在工程化病毒样颗粒（eVLP）递送中表现尤为优异，编辑效率较PE6c最高提升2.9倍。PE8c被推荐为标准引导编辑工作流程的首选起始变体。

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PE8d蛋白

PE8d（PE6d-D34）是一种基于M-MLV逆转录酶（RT）的AI引导重设计引导编辑器（Prime Editor）。其RT结构域通过ProteinMPNN进行全局序列重设计，在保留PE6d高催化活性的基础上，引入了81个氨基酸替换。重设计不仅恢复了PE6d在实验室进化过程中丧失的高温功能稳健性，还将细胞内蛋白表达水平（mRNA-LNP）提升2.0倍。PE8d在纠正ClinVar数据库中数百种致病突变时平均编辑效率提升1.4倍，尤其在小鼠体内展现了卓越的增益——在PCSK9位点实现10%平均编辑效率，较PE6d（3.5%）大幅提升2.9倍。在原代人T细胞中，PE8d在IL2RB位点的正交化编辑中表现出1.6倍（低剂量）的提升，是侧重体内效力及功能稳健性的重要变体。

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PE8max蛋白

PE8max（PEmax-D27）是一种基于M-MLV逆转录酶（RT）的AI引导重设计引导编辑器（Prime Editor）。其RT结构域通过ProteinMPNN进行最广泛的序列重设计，在保留PEmax高催化活性的基础上，引入了163个氨基酸替换（24%序列差异）。重设计显著改善了蛋白折叠热力学（Tm提升2°C）和细胞内可溶性表达（mRNA-LNP递送后蛋白水平提升2.1倍）。PE8max在纠正ClinVar数据库数百种致病突变时平均编辑效率提升1.2倍；在体内小鼠肝脏PCSK9位点实现4.8%平均编辑效率，较PEmax提升2.5倍；在人CD34+造血干细胞（HSPCs）中，以更低mRNA剂量（1 µg）实现了50%的HBB位点编辑效率（镰状细胞病相关修正）。PE8max是对PEmax系统最全面的升级替代品，兼具广谱适配性与强效编辑能力。

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GmPE蛋白

GmPE是大豆（Glycine max）中基于PEmax架构开发的引导编辑器（Prime Editor）基础版本。该系统包含由番茄SIEF1a启动子驱动的SpCas9切口酶（含R221K/N394K增强突变）与M-MLV逆转录酶（RT）融合蛋白，以及由U6复合启动子驱动的epegRNA（含evo preQ1结构基序）表达盒。GmPE在大豆毛状根中可实现1.7%–27.0%的编辑效率（均值12.1%），适用于大豆基因的精准单碱基替换、插入和缺失编辑。作为后续优化版本的参考基准，GmPE为大豆引导编辑技术的建立奠定了基础。

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GmePE蛋白

GmePE是大豆引导编辑器（Prime Editor）的增强型版本，在GmPE基础上对逆转录酶（RT）结构域进行了三重工程化改造：去除M-MLV RT的RNase H结构域、在RT催化结构域引入V223A氨基酸替换，以及在SpCas9与RT之间插入病毒核衣壳（NC）蛋白。这些改造协同作用，使GmePE在大豆毛状根中的编辑效率较GmPE提升1.2–2.6倍（平均1.9倍），编辑效率范围达3.9%–39.0%（均值18.9%）。GmePE是后续与DNA错配修复抑制（GmMLH1dn）协同优化的核心骨架，为大豆高效精准编辑提供了关键升级。

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GmMLH1dn蛋白

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基因/碱基/先导编辑器蛋白