SsCBE蛋白

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产品简介：

SsCBE的核心蛋白SsdAtox来源于Pseudomonassyringae（丁香假单胞菌）的毒素。SsdAtox属于DYW-like脱氨酶家族，该家族通常针对RNA，但SsdAtox对单链DNA(ssDNA)具有脱氨酶活性。

SsCBE是通过将SsdAtox融合到nCas9（Cas9的突变体，失去核酸酶活性但保留DNA结合能力）上构建的。为了提高编辑效率和减少脱靶效应，SsCBE还融合了尿嘧啶-DNA糖基化酶抑制剂（UGI）域。同时对SsdAtox进行了关键氨基酸突变，包括P282S、Y335R和K392E，形成了SRE（Specificity and Reduced toxicity）变体，显著提高了编辑效率和减少了细胞毒性。

SsCBE在多个内源性靶点上表现出显著的编辑效率提升，最高可达8.4倍。SsCBE在gRNA依赖的脱靶效应上表现出较高的特异性。

SsCBE能够高效地将C:G转换为T:A。

SsCBE的编辑窗口主要集中在目标序列的第4到第8个胞嘧啶位置，对GC富集区域的编辑效率无明显偏好。

SsCBE是一种基于Pseudomonassyringae的DYW-like脱氨酶SsdAtox的新型碱基编辑器。通过基因工程改造，SsCBE在核基因组和线粒体基因组中均表现出高效的C→T编辑能力，同时具有较低的细胞毒性和脱靶效应。其紧凑的结构和多样化的应用方式使其成为基因编辑领域的一个重要工具，为未来的基因治疗提供了新的可能性。

参考文献

Kweon, J. et al. High-efficiency base editing for nuclear and mitochondrial DNA with an optimized DYW-like deaminase. Mol. Ther. J. Am. Soc. Gene Ther. S1525-0016(25)00637–9 (2025) doi:10.1016/j.ymthe.2025.08.007.